В течение своей многовековой истории (2500 лет), Бухара не раз завоевывалась, разрушалась, теряла свое международное значение как центр духовной культуры на Востоке. Но каждый раз «Бухоро-и-Шариф» («благородная Бухара») вновь восстанавливалась, возрождались ее экономика, науки и искусство, сооружались новые здания. Первое упоминание о ней есть в священной книге «Авеста» под названием «вихар», что в переводе с санскрита означает «монастырь». На тот период это было маленькое селение в окружении болот.

В VI-VII вв. происходит уже развитие города, именовавшегося Нумиджкет. В IX-X вв. Бухара была столицей государства династии Саманидов, а в XI-XII вв. – династии Караханидов, крупнейшим политическим и экономическим центром Средней Азии. Средневековая Бухара состояла из цитадели, собственно города с семью воротами и пригорода с одиннадцатью воротами. В эту пору в ней воздвигаются дворцы правителей и знати, феодальные замки, культовые здания ислама. После опустошительного завоевания монгольскими ордами в начале XIII в., Бухара быстро восстанавливается и в XIV-XV вв. – это один из значительных городов Маверанахра. В XVI в. город становится столицей государства Шейбанидов (первая узбекская династия), в XVII в. – Аштарханидов, а также крупным центром мусульманства.

С конца XVIII в. по 1920 г. Бухара является столицей Бухарского эмирата. В настоящее время это областной центр, город-музей, сохранивший на своей территории и за ее пределами более 500 архитектурных памятников разных времен и эпох. Центральная часть «старого» города составляет целостный архитектурный ансамбль. Еще в советское время на вершинах куполов и минаретов гнездились священные птицы Бухары – аисты. На огромной высоте на фоне неба можно было увидеть четкий силуэт птицы. Это была одна из достопримечательностей города.